- Кружок
- 9-11 классы
- Студенты младших курсов вузов и СПО
- Базовый
Химия, физика и биология в драг-дизайне
Как с помощью компьютера проектируют будущие лекарства? Изучаем химию и физику драг-дизайна, знакомимся с биологическими мишенями и осваиваем программы для моделирования молекул. В финале — собственный проект гипотетической лекарственной молекулы
-
Старт
Уведомим вас заранее
-
Продолжительность
9 месяцев
-
Частота и длительность
1 раз в неделю по 90 минут
-
Размер группы
До 12 человек
О курсе
На курсе разберём физико-химические основы конструирования лекарств и биологию лекарственных мишеней. Познакомимся с практическими инструментами: Linux, веб-сервисами для фармакофорного моделирования, молекулярным докингом и молекулярной динамикой. Освоим инструменты хемоинформатики на Python. В итоговом проекте выберем мишень и предложим гипотетическую молекулу для взаимодействия с ней. Результат курса — учебная компьютерная модель, а не готовый лекарственный препарат.
Кому подойдёт
- Есть начальные знания химии
- Интересуется фармакологией
- Хочет познакомиться с компьютерным моделированием молекул
Программа
-
1
Введение в предмет
Цели курса и основы драг-дизайна. Выбор заболевания, поиск структур потенциальных мишеней в Protein Data Bank.
-
2
Химическая визуализация
Химические базы данных, взаимодействия белка и лиганда, молекулярные дескрипторы. Фармакофорное моделирование и молекулярный докинг.
-
3
Программы для углублённых исследований
Командная строка Linux, визуализация структур в PyMOL, молекулярная динамика в GROMACS и QSAR-моделирование.
-
4
Хемоинформатика на Python
Анализ химических данных с помощью Python и RDKit: визуализация молекул, расчёт дескрипторов и генерация конформеров.
-
5
Самостоятельный проект
Разработка гипотетической лекарственной молекулы от идеи до финальной структуры. Подготовка и защита проекта в формате мини-конференции.
Как проходят занятия
-
Теория
Небольшой теоретический блок на онлайн-занятии.
-
Демонстрация программ
Преподаватель показывает работу в программах через демонстрацию экрана. Учащиеся параллельно повторяют работу на своих компьютерах.
-
Вопросы в эфире
Участники задают вопросы и получают ответы во время занятия.
Преподаватели
Глеб Курницкий
Преподаватель кафедры физической химии МФТИ, аспирант МФТИ
- Преподаватель МФТИ
- Победитель олимпиады «Я — профессионал» по биотехнологии
«Играем в компьютерные игры с фармацевтикой!»
Вопросы
Нужно ли уметь программировать?
Нет, вся необходимая теория будет предоставлена на занятии, но бэкграунд приветствуется.
Какой компьютер и программы нужны?
Windows 10 или Windows 11, виртуальная машина или WSL. Приветствуется, если начальная ОС - Linux любого дистрибутива.
Узнайте о старте программы
Оставьте email. Когда откроется запись, мы сообщим вам и пришлём промокод со специальной скидкой для первых ЕНОТ-академиков